El contra-argumento sencillamente basado en esa misma lógica: "¿Y ud dónde ha buscado a Dios?" el cristiano respondería algo así como: "En todo el universo, en todo ser viviente, en la biblia y dentro de nuestro corazón." y muy campante el ateo podría contestar: "Hasta ahora lo que la ciencia ha descubierto sobre el universo, incluyendo la tierra, los conocimientos humanos y de nuestra propia anatomía, no ha habido ni una sóla señal de que un ser divino." "Pero yo sé que dios existe, lo he sentido, he leído la biblia y la ciencia aún es muy ignorante para entender a Dios." "Lo que ocurre dentro de su mente, cualquier sensación basada en la fé, no es una evidencia física y por lo tanto no es relevante."
Y así habrá un sinfin de argumentos. Pero como ha dicho Neil Degrasse Tyson, la ciencia ha iluminado mucho los conocimientos del universo, y siempre habrá un cristiano diciendo que la zona oscura(Desconocida por la ciencia) es "Dios" y cuando la ciencia la ilumine, de nuevo habrá más zonas oscuras que el cristiano señalará como "obra de Dios".
